src.util package

Submodules

src.util.util module

src.util.util.check_bond_existence(d1, d2, l1, l2)

src.util.util.check_continuity(a, b)

src.util.util.check_edge_in_tuplelist(edge, tpl)

src.util.util.check_following_migration(edges, p=0)

Parameters

edges –

Returns

src.util.util.compare(a, b)

src.util.util.flip(i)

src.util.util.get_absdist(domain1, domain2)

Parameters

• domain1 –

• domain2 –

Returns

src.util.util.get_closest_target(domains, targets)

Returns

src.util.util.get_closet_domain_to_target(target, domains)

Parameters

• target –

• domains –

Returns

src.util.util.get_combinations(oldlen, newlen, cursor, indexlist)

src.util.util.get_domains_on_2sides(target1, target2, domains1, domains2)

Parameters

• target1 –

• target2 –

• domains1 –

• domains2 –

Returns

src.util.util.get_edge_info(e)

src.util.util.get_free_domains(limits, blocks, bound)

src.util.util.get_migrate_nodes(edges, indices, startstrand)

src.util.util.get_reverse(n)

src.util.util.sort_by_strand(val)

src.util.util.sort_e_by_domain(val)

Module contents